La microbiologia è una branca della biologia che studia la struttura e le funzioni dei microrganismi, cioè gli organismi viventi non visibili ad occhio nudo: le Monere (principalmente batteri), alcuni tipi di funghi, di lieviti, di alghe unicellulari e i Protozoi. Inoltre studia anche organismi non definiti viventi in senso stretto, i virus e i prioni. Si sovrappone parzialmente alla micologia (lo studio dei funghi, dai macromiceti, che possono raggiungere ragguardevoli dimensioni, ai micromiceti, molto più numerosi dei primi e infinitamente più piccoli) e sue suddivisioni sono la batteriologia (studio dei batteri), la virologia (studio dei virus) e la protozoologia (studio dei protozoi).
La microbiologia nacque praticamente nella prima metà del XIX sec. (teoria microbica delle malattie di Robert Koch), anche se l’esistenza dei microrganismi era nota fin dal XVII sec., grazie all’invenzione del primo microscopio dovuta a Robert Hooke.
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